مرجع
مرجع آنزیم محدودکننده
مرجع جستوجوپذیر آنزیمهای محدودکنندهٔ رایج: جایگاه شناسایی با علامت محل برش، دُمی که باقی میگذارد، اینکه آنزیم نوع II است یا نوع IIS، و کدامها اسببارکشهای روزمرهٔ همسانهسازیاند. با نام یا با توالی شناسایی فیلتر کنید.
| آنزیم | جایگاه شناسایی | دُم | نوع | رایج |
|---|---|---|---|---|
| AatII | GACGT^C | دُم ′۳ | نوع II | — |
| AflII | C^TTAAG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| AgeI | A^CCGGT | دُم ′۵ | نوع II | — |
| AluI | AG^CT | صاف | نوع II | بله |
| ApaI | GGGCC^C | دُم ′۳ | نوع II | — |
| AscI | GG^CGCGCC | دُم ′۵ | نوع II | — |
| AvrII | C^CTAGG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| BamHI | G^GATCC | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| BbsI | GAAGAC | دُم ′۵ | نوع IIS | بله |
| BclI | T^GATCA | دُم ′۵ | نوع II | — |
| BglII | A^GATCT | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| BsaI | GGTCTC | دُم ′۵ | نوع IIS | بله |
| BsmBI | CGTCTC | دُم ′۵ | نوع IIS | بله |
| BspEI | T^CCGGA | دُم ′۵ | نوع II | — |
| BspQI | GCTCTTC | دُم ′۵ | نوع IIS | — |
| BsrGI | T^GTACA | دُم ′۵ | نوع II | — |
| BstBI | TT^CGAA | دُم ′۵ | نوع II | — |
| ClaI | AT^CGAT | دُم ′۵ | نوع II | — |
| DdeI | C^TNAG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| DraI | TTT^AAA | صاف | نوع II | — |
| EagI | C^GGCCG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| EcoRI | G^AATTC | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| EcoRV | GAT^ATC | صاف | نوع II | بله |
| FseI | GGCCGG^CC | دُم ′۳ | نوع II | — |
| HaeIII | GG^CC | صاف | نوع II | بله |
| HhaI | GCG^C | دُم ′۳ | نوع II | — |
| HindIII | A^AGCTT | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| HinfI | G^ANTC | دُم ′۵ | نوع II | — |
| HpaI | GTT^AAC | صاف | نوع II | — |
| HpaII | C^CGG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| KpnI | GGTAC^C | دُم ′۳ | نوع II | بله |
| MboI | ^GATC | دُم ′۵ | نوع II | — |
| MfeI | C^AATTG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| MluI | A^CGCGT | دُم ′۵ | نوع II | — |
| MspI | C^CGG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| NarI | GG^CGCC | دُم ′۵ | نوع II | — |
| NcoI | C^CATGG | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| NdeI | CA^TATG | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| NheI | G^CTAGC | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| NotI | GC^GGCCGC | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| NruI | TCG^CGA | صاف | نوع II | — |
| NsiI | ATGCA^T | دُم ′۳ | نوع II | — |
| PacI | TTAAT^TAA | دُم ′۳ | نوع II | — |
| PciI | A^CATGT | دُم ′۵ | نوع II | — |
| PmeI | GTTT^AAAC | صاف | نوع II | — |
| PstI | CTGCA^G | دُم ′۳ | نوع II | بله |
| PvuII | CAG^CTG | صاف | نوع II | بله |
| RsaI | GT^AC | صاف | نوع II | — |
| SacI | GAGCT^C | دُم ′۳ | نوع II | بله |
| SacII | CCGC^GG | دُم ′۳ | نوع II | — |
| SalI | G^TCGAC | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| SapI | GCTCTTC | دُم ′۵ | نوع IIS | — |
| Sau3AI | ^GATC | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| SbfI | CCTGCA^GG | دُم ′۳ | نوع II | — |
| ScaI | AGT^ACT | صاف | نوع II | — |
| SmaI | CCC^GGG | صاف | نوع II | بله |
| SnaBI | TAC^GTA | صاف | نوع II | — |
| SpeI | A^CTAGT | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| SphI | GCATG^C | دُم ′۳ | نوع II | — |
| StuI | AGG^CCT | صاف | نوع II | — |
| SwaI | ATTT^AAAT | صاف | نوع II | — |
| TaqI | T^CGA | دُم ′۵ | نوع II | — |
| XbaI | T^CTAGA | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| XhoI | C^TCGAG | دُم ′۵ | نوع II | بله |
| XmaI | C^CCGGG | دُم ′۵ | نوع II | — |
| هیچ آنزیمی با این جستوجو نمیخواند. | ||||
65 آنزیم فهرست شده
علامت ^ محل برش رشتهٔ بالا را برای آنزیمهای نوع II نشان میدهد. آنزیمهای نوع IIS در فاصلهٔ ثابتی بیرون از جایگاه شناسایی میبرند، پس علامتی نشان داده نمیشود؛ برای جایگذاری دقیق برش روی یک توالی از ابزار جایگاههای برش استفاده کنید.
مرجعی سریع برای طراحی همسانهسازی. برای یافتن محل برش این آنزیمها روی یک توالی مشخص، یا پویش جایگاههای یکتا و نابرنده، از ابزار جایگاههای برش استفاده کنید. جایگاههای شناسایی از ′۵ به ′۳ روی رشتهٔ بالا نوشته شدهاند.
پرسشهای متداول
چطور بفهمم آنزیم کجای توالی من میبُرد؟
این صفحه جدول جستوجوست، نه پویشگر. توالی خود را در ابزار جایگاههای برش بچسبانید تا محل برشها نقشه شود، قطعهها شمرده شوند و آنزیمهای یکتا یا نابرنده یافت شوند.
چرا برخی آنزیمها علامت برش ندارند؟
آنزیمهای نوع IIS یک توالی را میشناسند ولی در فاصلهٔ معیّنی از آن میبُرند، پس علامت داخل جایگاه گمراهکننده میشد. ابزار جایگاههای برش برش آنها را روی توالی واقعی درست جای میگذارد.
آیا دو آنزیم با جایگاه یکسان یکسان میبُرند؟
ایزوشیزومرها توالی شناسایی مشترک دارند ولی ممکن است در موقعیتهای متفاوت ببرند یا دُمهای متفاوت بگذارند، و در فعالیت ستارهای و نیاز بافری فرق دارند. برای آنزیم دقیقی که بهکار میبرید دادهٔ سازنده را ببینید.