Справочник
Справочник рестриктаз
Поисковый справочник распространённых рестриктаз: сайт узнавания с отмеченной позицией разреза, оставляемый выступ, тип II или IIS, и какие из них — повседневные рабочие лошадки клонирования. Фильтруйте по названию или по последовательности узнавания.
| Фермент | Сайт узнавания | Выступ | Тип | Часто |
|---|---|---|---|---|
| AatII | GACGT^C | 3′-выступ | Тип II | — |
| AflII | C^TTAAG | 5′-выступ | Тип II | — |
| AgeI | A^CCGGT | 5′-выступ | Тип II | — |
| AluI | AG^CT | тупой | Тип II | да |
| ApaI | GGGCC^C | 3′-выступ | Тип II | — |
| AscI | GG^CGCGCC | 5′-выступ | Тип II | — |
| AvrII | C^CTAGG | 5′-выступ | Тип II | — |
| BamHI | G^GATCC | 5′-выступ | Тип II | да |
| BbsI | GAAGAC | 5′-выступ | Тип IIS | да |
| BclI | T^GATCA | 5′-выступ | Тип II | — |
| BglII | A^GATCT | 5′-выступ | Тип II | да |
| BsaI | GGTCTC | 5′-выступ | Тип IIS | да |
| BsmBI | CGTCTC | 5′-выступ | Тип IIS | да |
| BspEI | T^CCGGA | 5′-выступ | Тип II | — |
| BspQI | GCTCTTC | 5′-выступ | Тип IIS | — |
| BsrGI | T^GTACA | 5′-выступ | Тип II | — |
| BstBI | TT^CGAA | 5′-выступ | Тип II | — |
| ClaI | AT^CGAT | 5′-выступ | Тип II | — |
| DdeI | C^TNAG | 5′-выступ | Тип II | — |
| DraI | TTT^AAA | тупой | Тип II | — |
| EagI | C^GGCCG | 5′-выступ | Тип II | — |
| EcoRI | G^AATTC | 5′-выступ | Тип II | да |
| EcoRV | GAT^ATC | тупой | Тип II | да |
| FseI | GGCCGG^CC | 3′-выступ | Тип II | — |
| HaeIII | GG^CC | тупой | Тип II | да |
| HhaI | GCG^C | 3′-выступ | Тип II | — |
| HindIII | A^AGCTT | 5′-выступ | Тип II | да |
| HinfI | G^ANTC | 5′-выступ | Тип II | — |
| HpaI | GTT^AAC | тупой | Тип II | — |
| HpaII | C^CGG | 5′-выступ | Тип II | — |
| KpnI | GGTAC^C | 3′-выступ | Тип II | да |
| MboI | ^GATC | 5′-выступ | Тип II | — |
| MfeI | C^AATTG | 5′-выступ | Тип II | — |
| MluI | A^CGCGT | 5′-выступ | Тип II | — |
| MspI | C^CGG | 5′-выступ | Тип II | — |
| NarI | GG^CGCC | 5′-выступ | Тип II | — |
| NcoI | C^CATGG | 5′-выступ | Тип II | да |
| NdeI | CA^TATG | 5′-выступ | Тип II | да |
| NheI | G^CTAGC | 5′-выступ | Тип II | да |
| NotI | GC^GGCCGC | 5′-выступ | Тип II | да |
| NruI | TCG^CGA | тупой | Тип II | — |
| NsiI | ATGCA^T | 3′-выступ | Тип II | — |
| PacI | TTAAT^TAA | 3′-выступ | Тип II | — |
| PciI | A^CATGT | 5′-выступ | Тип II | — |
| PmeI | GTTT^AAAC | тупой | Тип II | — |
| PstI | CTGCA^G | 3′-выступ | Тип II | да |
| PvuII | CAG^CTG | тупой | Тип II | да |
| RsaI | GT^AC | тупой | Тип II | — |
| SacI | GAGCT^C | 3′-выступ | Тип II | да |
| SacII | CCGC^GG | 3′-выступ | Тип II | — |
| SalI | G^TCGAC | 5′-выступ | Тип II | да |
| SapI | GCTCTTC | 5′-выступ | Тип IIS | — |
| Sau3AI | ^GATC | 5′-выступ | Тип II | да |
| SbfI | CCTGCA^GG | 3′-выступ | Тип II | — |
| ScaI | AGT^ACT | тупой | Тип II | — |
| SmaI | CCC^GGG | тупой | Тип II | да |
| SnaBI | TAC^GTA | тупой | Тип II | — |
| SpeI | A^CTAGT | 5′-выступ | Тип II | да |
| SphI | GCATG^C | 3′-выступ | Тип II | — |
| StuI | AGG^CCT | тупой | Тип II | — |
| SwaI | ATTT^AAAT | тупой | Тип II | — |
| TaqI | T^CGA | 5′-выступ | Тип II | — |
| XbaI | T^CTAGA | 5′-выступ | Тип II | да |
| XhoI | C^TCGAG | 5′-выступ | Тип II | да |
| XmaI | C^CCGGG | 5′-выступ | Тип II | — |
| Ни один фермент не соответствует поиску. | ||||
65 ферментов в списке
Каретка отмечает разрез верхней цепи для ферментов типа II. Ферменты типа IIS режут на фиксированном расстоянии вне сайта узнавания, поэтому каретка не показана; чтобы разместить точный разрез на последовательности, используйте инструмент сайтов рестрикции.
Быстрый справочник для планирования клонирования. Чтобы найти, где эти ферменты режут конкретную последовательность, или искать уникальные и нережущие сайты, используйте инструмент сайтов рестрикции. Сайты узнавания записаны 5′→3′ на верхней цепи.
Частые вопросы
Как узнать, где фермент режет мою последовательность?
Эта страница — таблица поиска, а не сканер. Вставьте последовательность в инструмент сайтов рестрикции, чтобы разметить позиции разрезов, сосчитать фрагменты и найти уникальные или нережущие ферменты.
Почему у некоторых ферментов нет метки разреза?
Ферменты типа IIS узнают одну последовательность, но режут на заданном расстоянии от неё, поэтому каретка внутри сайта вводила бы в заблуждение. Инструмент сайтов рестрикции размещает их разрез верно на реальной последовательности.
Одинаково ли режут два фермента с одним сайтом?
Изошизомеры имеют общий сайт узнавания, но могут резать в разных позициях или оставлять разные концы, и различаются по звёздной активности и требованиям к буферу. Сверьтесь с данными поставщика для конкретного фермента.