BIOTOOLS.ir

Биотехнологический набор инструментов

Вставьте последовательность — ответ здесь.

Пятнадцать лабораторных инструментов, работающих прямо в вашем браузере. Последовательности не отправляются на сервер, а для начала работы аккаунт не нужен.

Нуклеотидная последовательность
0Длина
0%Доля GC
Темп. плавления
Мол. масса

Инструменты

Векторы

Виртуальное клонирование

Моделирование гидролиза и лигирования с проверкой рамки считывания

Векторы

Автоаннотация вектора

Поиск промоторов, меток, сайтов протеаз и рекомбинации в последовательности

ПЦР

Мастер-микс для ПЦР

Таблица компонентов на любое число пробирок с заготовками для ПЦР, ОТ и ПЦР с колонии

ПЦР

Размер продукта ПЦР

Поиск сайтов посадки праймеров на матрице, длина ампликона и проверка специфичности

ПЦР

Температурный градиент ПЦР

Температуры колонок по Tm праймеров и рекомендуемый диапазон

Клеточная культура

Посев клеток и коэффициент пассирования

Число клеток на сосуд, объём суспензии и расчёт пассажа

Клеточная культура

Пересчёт между сосудами

Перевод протокола, написанного для одного сосуда, на другой по площади роста

Клеточная культура

Подсчёт клеток

Концентрация и общее число клеток по подсчёту в камере Горяева или по готовому значению

Клеточная культура

Жизнеспособность с трипановым синим

Процент жизнеспособности и выход живых клеток по числу живых и мёртвых

Клеточная культура

Пассаж и удвоения популяции

Удвоения популяции, кумулятивный PDL и время удвоения по посеву и сбору

Клеточная культура

Настройка трансфекции

ДНК и реагент на лунку по выбранному соотношению с масштабированием на планшет

Клеточная культура

Окрашивание для проточной цитометрии

Клеток на пробирку, антитела на тест по титру и время сбора

Анализ

MTT-тест жизнеспособности

Процент жизнеспособности по поглощению с интерполированной IC50 для серии доз

Транскриптом

Нормализация счётов: CPM, TPM, FPKM

Перевод матрицы сырых счётов в нормализованные значения со статистикой библиотек

Транскриптом

Поправка на множественность и вулкан-график

Четыре метода поправки p-значений и построение вулкан-графика по выводу DESeq2 или edgeR

Транскриптом

Анатомия транскрипта

Поиск CDS, длины UTR, трансляция белка и оценка контекста Козак

Работа с животными

Объём опухоли по штангенциркулю

Объём, кривые роста и время удвоения по измерениям штангенциркулем

Работа с животными

Подготовка дозы и инъекции

От мг/кг к объёму на каждое животное и к количеству исходного раствора и растворителя

Работа с животными

Возраст животного и перевод единиц

Возраст от даты рождения, планирование до целевого возраста и перевод единиц

Векторы

Мастер-микс для ПЦР

Таблица компонентов на любое число пробирок с заготовками для ПЦР, ОТ и ПЦР с колонии

Последовательности

Обратный комплемент

Комплемент, реверс и РНК одним нажатием

Последовательности

Трансляция и ORF

Трансляция в шести рамках и поиск ORF

Последовательности

Сайты рестрикции

Виртуальный гидролиз и модель геля

Последовательности

Праймеры и Tm

Димеры, шпильки и температура отжига

Последовательности

Оптимизация кодонов

Для E. coli, дрожжей, CHO и растений

Белки

Параметры белка

Масса, pI, экстинкция и стабильность

Белки

График гидрофобности

Кайт-Дулиттл с настраиваемым окном

Белки

Концентрация по A280

Пересчёт в мг/мл и микромоли

Калькуляторы

Разведение

C₁V₁ и планировщик серийных разведений

Калькуляторы

нг и пмоль

Для плазмид, вставок и олигонуклеотидов

Калькуляторы

RCF и об/мин

С радиусами распространённых роторов

Калькуляторы

Рецепты буферов

Tris, PBS, TAE и LB в любом объёме

Анализ

qPCR по ΔΔCt

Загрузите CSV и получите fold change

Анализ

Калибровочная кривая

Линейная и четырёхпараметрическая аппроксимация

Анализ

Размер полосы на геле

Полулогарифмическая интерполяция по маркеру

Справочник

Таблица генетического кода

Стандартная таблица кодонов со старт- и стоп-кодонами и заметными митохондриальными переназначениями

Справочник

Свойства аминокислот

Двадцать аминокислот с массой остатка, гидропатией, pKa боковой цепи, классом и кодонами

Справочник

Справочник рестриктаз

Поисковый список распространённых рестриктаз с сайтами узнавания, позициями разреза, выступом и типом

Справочник

Справочник антибиотиков

Исходные и рабочие концентрации, растворитель и хранение для распространённых антибиотиков бактериальной селекции

Белки

Рецепт геля SDS-PAGE

Объёмы компонентов разделяющего и концентрирующего гелей по проценту, объёму и числу гелей

Белки

Разведение антител для вестерн-блота

Объёмы антитела и разбавителя для первичной и вторичной инкубаций на нескольких мембранах

Белки

Выход белка

Общий белок из концентрации и объёма, с выходом относительно исходного количества и выходом на литр