Collez une séquence. La réponse est ici.

Vecteurs

Clonage virtuel

Simuler une digestion et une ligature en vérifiant le cadre de lecture

Vecteurs

Annotation automatique de vecteur

Repérer promoteurs, étiquettes, sites de protéase et de recombinaison dans une séquence

PCR

Mélange réactionnel PCR

Un tableau de composants pour tout nombre de tubes, avec des modèles pour PCR, RT et PCR sur colonie

PCR

Taille du produit PCR

Localiser les sites d’hybridation des amorces, dimensionner l’amplicon et vérifier la spécificité

PCR

Gradient de température PCR

Températures des colonnes d’après les Tm de vos amorces, avec une plage suggérée

Culture cellulaire

Ensemencement et taux de passage

Cellules nécessaires par récipient, volume de suspension et calcul du passage

Culture cellulaire

Mise à l’échelle entre récipients

Convertir un protocole écrit pour un récipient vers un autre selon la surface de culture

Culture cellulaire

Comptage cellulaire

Concentration et nombre total de cellules à partir d’un comptage en hématimètre ou d’une valeur connue

Culture cellulaire

Viabilité au bleu trypan

Pourcentage de viabilité et rendement en cellules vivantes à partir des comptages vivant et mort

Culture cellulaire

Passage et doublements de population

Doublements de population, PDL cumulé et temps de doublement à partir de l’ensemencement et de la récolte

Culture cellulaire

Configuration de transfection

ADN et réactif par puits selon un ratio choisi, mis à l’échelle sur une plaque

Culture cellulaire

Marquage en cytométrie en flux

Cellules par tube, anticorps par test selon son titre, et temps d’acquisition

Analyse

Test de viabilité MTT

Pourcentage de viabilité à partir de l’absorbance, avec une CI50 interpolée pour une série de doses

Transcriptome

Normalisation des comptages : CPM, TPM, FPKM

Convertir une matrice de comptages bruts en valeurs normalisées, avec les statistiques de librairie

Transcriptome

Correction des tests multiples et volcano

Corriger les p-valeurs par quatre méthodes et tracer un volcano à partir de DESeq2 ou edgeR

Transcriptome

Anatomie du transcrit

Trouver le CDS, mesurer les UTR, traduire la protéine et juger le contexte Kozak

Expérimentation animale

Volume tumoral au pied à coulisse

Volume, courbes de croissance et temps de doublement à partir des mesures

Expérimentation animale

Préparation de la dose et de l’injection

De mg/kg au volume par animal et aux quantités de solution mère et de véhicule

Expérimentation animale

Âge de l’animal et conversion d’unités

Âge depuis la date de naissance, planification jusqu’à un âge cible, conversion d’unités

Vecteurs

Mélange réactionnel PCR

Un tableau de composants pour tout nombre de tubes, avec des modèles pour PCR, RT et PCR sur colonie

Séquences

Complément inverse

Complément, inversion et ARN en un clic

Séquences

Traduction et ORF

Traduction en six cadres et cadres ouverts

Séquences

Sites de restriction

Digestion virtuelle et gel simulé

Séquences

Amorces et Tm

Dimères, épingles et température d’hybridation

Séquences

Optimiseur de codons

Pour E. coli, levure, CHO et plantes

Protéines

Paramètres protéiques

Masse, pI, extinction et stabilité

Protéines

Profil d’hydropathie

Kyte-Doolittle à fenêtre réglable

Protéines

Concentration par A280

Absorbance en mg/ml et micromolaire

Calculateurs

Dilution

C₁V₁ et plan de dilutions en série

Calculateurs

ng et pmol

Pour plasmides, inserts et oligos

Calculateurs

RCF et tr/min

Avec les rayons des rotors courants

Calculateurs

Recettes de tampons

Tris, PBS, TAE et LB à toute échelle

Analyse

qPCR ΔΔCt

Importez un CSV, obtenez le fold change

Analyse

Courbe étalon

Ajustement linéaire et à quatre paramètres

Analyse

Taille de bande sur gel

Interpolation semi-log à partir du marqueur

Référence

Table du code génétique

La table standard des codons avec codons d’initiation et d’arrêt, et les réassignations mitochondriales notables

Référence

Propriétés des acides aminés

Les vingt acides aminés avec masse du résidu, hydropathie, pKa de chaîne latérale, classe et codons

Référence

Référence des enzymes de restriction

Une liste consultable des enzymes de restriction courantes avec sites de reconnaissance, positions de coupure, extrémité et type

Référence

Référence des antibiotiques

Concentrations mère et de travail, solvant et conservation des antibiotiques de sélection bactérienne courants

Protéines

Recette de gel SDS-PAGE

Volumes des composants des gels de séparation et de concentration selon le pourcentage, le volume et le nombre de gels

Protéines

Dilution d’anticorps pour western blot

Volumes d’anticorps et de diluant pour les incubations primaire et secondaire sur plusieurs membranes

Protéines

Rendement protéique

Protéine totale à partir de la concentration et du volume, avec récupération sur une quantité de départ et rendement par litre