BIOTOOLS.ir

جعبه‌ابزار آنلاین بیوتکنولوژی

توالی را بچسبان، جواب را همین‌جا بگیر.

پانزده ابزار آزمایشگاهی که داخل مرورگر خودتان اجرا می‌شوند. هیچ توالی‌ای روی سرور ما آپلود نمی‌شود و برای شروع کار به حساب کاربری نیاز ندارید.

توالی نوکلئوتیدی
0طول
0%درصد GC
دمای ذوب
وزن مولکولی

ابزارها

وکتور

کلونینگ مجازی

شبیه‌سازی برش و اتصال با بررسی هم‌قاب بودن سازهٔ نهایی

وکتور

حاشیه‌نویسی خودکار وکتور

شناسایی پروموتر، تگ، جایگاه پروتئاز و نواحی نوترکیبی روی توالی

PCR

مسترمیکس PCR

جدول اجزای واکنش برای هر تعداد لوله، با قالب‌های آماده برای PCR، RT و کلنی

PCR

اندازهٔ محصول PCR

یافتن جایگاه اتصال پرایمرها روی الگو، طول آمپلیکون و بررسی اختصاصی بودن

PCR

گرادیان دمای PCR

دماهای هر ستون بلوک بر پایهٔ Tm پرایمرها و پیشنهاد بازهٔ مناسب

کشت سلولی

کاشت سلول و نسبت پاساژ

تعداد سلول لازم برای هر ظرف، حجم سوسپانسیون و محاسبهٔ اسپلیت

کشت سلولی

مقیاس‌گذاری بین ظروف

تبدیل پروتکل نوشته‌شده برای یک ظرف به ظرف دیگر بر اساس نسبت سطح کشت

کشت سلولی

شمارش سلول

غلظت و تعداد کل سلول از شمارش لام هموسیتومتر یا از عدد آماده

کشت سلولی

زنده‌مانی با تریپان‌بلو

درصد زنده‌مانی و بازده سلول زنده از شمارش زنده و مرده

کشت سلولی

پاساژ و دوبل‌شدن جمعیت

دوبل‌شدن جمعیت، PDL تجمعی و زمان دوبل‌شدن از کشت و برداشت

کشت سلولی

تنظیم ترانسفکشن

DNA و معرف در هر چاهک بر پایهٔ نسبت انتخابی، مقیاس‌شده روی پلیت

کشت سلولی

رنگ‌آمیزی فلوسایتومتری

سلول در هر لوله، آنتی‌بادی هر تست از تیترش، و زمان اکتساب

تحلیل داده

سنجش زنده‌مانی MTT

درصد زنده‌مانی از جذب، همراه IC50 درون‌یابی‌شده برای سری غلظتی

ترانسکریپتوم

نرمال‌سازی شمارش: CPM و TPM و FPKM

تبدیل ماتریس شمارش خام به مقادیر نرمال‌شده، با آمار کتابخانه

ترانسکریپتوم

تصحیح چندگانه و نمودار آتشفشانی

تصحیح p-value با چهار روش و رسم نمودار آتشفشانی از خروجی DESeq2 یا edgeR

ترانسکریپتوم

آناتومی ترانسکریپت

یافتن CDS، طول UTRها، پروتئین حاصل و بررسی زمینهٔ کوزاک

کار با حیوان

حجم تومور از کولیس

محاسبهٔ حجم، منحنی رشد و زمان دوبرابر شدن از اندازه‌گیری با کولیس

کار با حیوان

آماده‌سازی دوز و تزریق

از mg/kg تا حجم تزریقی هر حیوان و مقدار استوک و حلال لازم

کار با حیوان

سن حیوان و تبدیل واحد

محاسبهٔ سن از تاریخ تولد، برنامه‌ریزی رسیدن به سن هدف، و تبدیل واحد

وکتور

مسترمیکس PCR

جدول اجزای واکنش برای هر تعداد لوله، با قالب‌های آماده برای PCR، RT و کلنی

توالی

مکمل معکوس و رونویسی

مکمل، معکوس و RNA با یک کلیک

توالی

ترجمه و ORF

ترجمهٔ شش‌قابی و یافتن چارچوب باز

توالی

جایگاه‌های برشی

هضم مجازی و شبیه‌سازی ژل

توالی

پرایمر و Tm

دایمر، هرپین و دمای اتصال

توالی

بهینه‌ساز کدون

برای E. coli، مخمر، CHO و گیاه

پروتئین

پارامترهای پروتئین

وزن، pI، ضریب خاموشی و پایداری

پروتئین

نمودار هیدروپاتی

Kyte-Doolittle با پنجرهٔ دلخواه

پروتئین

غلظت از روی A280

تبدیل جذب به mg/ml و میکرومولار

ماشین‌حساب

رقت‌سازی

C₁V₁ و طراحی سری رقت

ماشین‌حساب

تبدیل ng و pmol

برای پلاسمید، اینسرت و اولیگو

ماشین‌حساب

RCF و RPM

با شعاع روتورهای رایج

ماشین‌حساب

دستور بافرها

Tris، PBS، TAE و LB با مقیاس دلخواه

تحلیل داده

qPCR با روش ΔΔCt

آپلود CSV و خروجی fold change

تحلیل داده

منحنی استاندارد

برازش خطی و چهارپارامتری

تحلیل داده

اندازهٔ باند ژل

درون‌یابی نیمه‌لگاریتمی از روی مارکر

مرجع

جدول کد ژنتیکی

جدول استاندارد کدون‌ها با کدون‌های آغاز و پایان، و بازتخصیص‌های مهم میتوکندریایی

مرجع

ویژگی‌های اسید آمینه

بیست اسید آمینه با جرم باقی‌مانده، آب‌گریزی، pKa زنجیرهٔ جانبی، دسته و کدون‌ها

مرجع

مرجع آنزیم محدودکننده

فهرست جست‌وجوپذیر آنزیم‌های محدودکنندهٔ رایج با جایگاه شناسایی، محل برش، دُم و نوع

مرجع

مرجع آنتی‌بیوتیک

غلظت استوک و کاری، حلال و نگهداری برای آنتی‌بیوتیک‌های رایج گزینش باکتریایی

پروتئین

دستور ژل SDS-PAGE

حجم اجزای ژل جداکننده و متراکم‌کننده از درصد، حجم و تعداد ژل

پروتئین

رقت آنتی‌بادی وسترن‌بلات

حجم آنتی‌بادی و رقیق‌کننده برای انکوباسیون اولیه و ثانویه روی چند غشا

پروتئین

بازده پروتئین

پروتئین کل از غلظت و حجم، با بازیابی نسبت به مقدار آغازین و بازده در هر لیتر